HPC para la filogenética tutorial tiene como objetivo reducir el tiempo de análisis 29 -

Contacto: Catherine Crawley

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865-974-9350

Instituto Nacional de Matemática y Síntesis Biológica (NIMBioS)

HPC para la filogenética tutorial tiene como objetivo reducir el tiempo de análisis

Un análisis filogenético puede tardar mucho tiempo en ejecutarse, pero hay maneras de hacerlo más eficiente y eficaz. El Instituto Nacional de Matemática y Síntesis Biológica (NIMBioS) serán los anfitriones de un tutorial de octubre 13 al 15 se centra en la informática de alto rendimiento (HPC) para la filogenética.

"Fast, Phylogenies royalties: HPC para Phylogenetics" se centra en cómo utilizar TeraGrid, el Portal de CIPRES, el medio ambiente iPlant Descubrimiento, grupos universitarios, y otros recursos de HPC normalmente libre para el análisis filogenético. El tutorial está orientado principalmente hacia los biólogos, incluyendo a estudiantes, investigadores postdoctorales y profesores, que son al menos moderadamente experimentados con el análisis filogenético y que tienen conjuntos de datos para ejecutar, pero que por lo general se ejecutan los análisis en sus propios escritorios, pero el material es también apropiado para los investigadores, tales como los estadísticos o matemáticos que trabajan en la filogenética, así como los investigadores que trabajan en equipo, como una pareja formada por un biólogo y un estadístico que colaboran en su trabajo.

Un webinar y recursos en línea a su propio ritmo uso básico unix también se ofrecerá antes del taller, que se celebrará en NIMBioS en la Universidad de Tennessee, Knoxville, campus.

Tutorial instructores y organizadores incluyen a Eric Carr (NIMBioS); Jim Ferguson (Instituto Nacional de Ciencias de la Computación, Universidad del Laboratorio Nacional de Tennessee / Oak Ridge.); Susan Holmes (Stanford Univ.).; Brian O'Meara (Univ. Tennessee); Alexis Stamatakis (Univ. Técnica de Munich.); Dan Stanzione (Texas Advanced Computing Center / iPlant); Bob Thomson (Universidad de California Davis); y James Wilgenbusch (Florida State University.).

Otros anfitriones para el tutorial son iPlant, Laboratorio Nacional de Oak Ridge y el Instituto Nacional de Ciencias de la Computación.

NIMBioS Tutoriales implican 30-40 participantes. Para obtener más información acerca de la guía de aprendizaje, visitehttp :/ / nimbios.org/tutorials/TT_hpc2010

El Instituto Nacional de Matemática y Síntesis Biológica (NIMBioS) reúne a investigadores de todo el mundo para colaborar a través de las fronteras disciplinarias para investigar soluciones a los problemas de base y en las ciencias de la vida aplicadas. NIMBioS es patrocinado por la National Science Foundation, el Departamento de Seguridad Nacional de EE.UU., y el Departamento de Agricultura de EE.UU., con el apoyo adicional de la Universidad de Tennessee, Knoxville.